Bei der praktischen Nutzung des One-Time-Pads gibt es nicht nur einen Schlüssel, der verwendet wird, um danach keinerlei Kommunikation mehr vorzunehmen. Stattdessen sind vielfältige Szenarien denkbar, die eine gewisse Verwaltung erfordern:

• Es gibt mehrere Kontakte, mit denen man kommuniziert
• Man hat mehrere Schlüssel je Kontakt
• Die Kommunikation soll in beide Richtungen (Senden und Empfangen) möglich sein
• Die Priorität der Nachricht soll (ebenfalls verschlüsselt) mitgeteilt werden

Schlüssel-ID
Mit der Schlüssel-ID wird gekennzeichnet, welcher Schlüssel zur Entschlüsselung zu verwenden ist. Es sollte sich um eine zufällige oder serielle vierstellige Zahl handeln, die genau gleich (d.h. nicht als Invers) auf beiden Fassungen des Schlüssels angegeben ist. Diese ist bei jedem Versand einer verschlüsselten Nachricht anzugeben, um die richtige Zuordnung zu ermöglichen.

Richtung der Nachricht
Auf ein paar aus zwei Schlüsseln mit gleicher ID wird jeweils tx und rx geschrieben. tx steht für transmit, bezeichnet den Schlüssel zum Senden. rx steht für receive, und ist zum Empfang der Nachricht. Eine Person darf somit nicht den tx- und rx-Schlüssel mit der gleichen ID besitzen, da sonst keine Kommunikation möglich ist. Dies muss beim Schlüsselaustausch beachtet werden. Das Verhältnis von tx- und rx-Schlüsseln richtet sich nach praktischen Aspekten. So kann zu erwarten sein, dass jemand weitaus mehr Nachrichten senden als Empfangen muss. Nicht zwangsläufig muss daher die Verteilung gleichmäßig sein.

Prioritätsziffer
Auf jedem Schlüssel sollte eine Prioritätsziffer stehen. Damit kann der Empfänger schnell prüfen, ob er die Bearbeitung sofort oder demnächst vornehmen sollte. Es handelt sich bei dieser Ziffer gewissermaßen um einen Schlüssel der Länge 1, der daher gleichverteilt zufällig und mit Invers auf dem jeweils anderen Blatt angegeben sein muss.

Je höher die (entschlüsselte) Priorität, desto dringender ist die Nachricht. Ergänzend können die Kommunikationspartner/-innen weiteres vereinbaren, z.B. dass nur bestimmte Vorfälle gewisse Priorität rechtfertigen.